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CircRNA测序
产品简介

           circRNA 是最近发现的一类特殊的 lncRNA,广泛存在于动物和植物中的。circRNA 表达具有组织特异性;其独特的环状结构使其能够逃逸 RNAse 酶的降解,具有很强的胞内稳定性,能够长效行使转录“调控者”的职能。circRNA 在生物的发育及分化过程中,起重要调控作用。

技术流程



样品要求

1)样品类型:纯净细胞系、组织、去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA;
 
2)样品需求量:(去除rRNA、去除线性RNA)的链特异性文库:样品Total RNA≥20 μg;
 
3)样品浓度:(去除rRNA、去除线性RNA)的链特异性文库:≥200 ng/μl;
 
4)样品纯度:OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,样品RIN ≥ 7.0,28S:18S≥1.0。

案例解析
       
环状RNA最早发现于20世纪初期,但人们对其功能知之甚少,也没有研究它
的有效方法,随着高通量测序技术的发展,推动了环状RNA的研究,发现环状RNA并非是基因组内的“暗物质”,而是执行多种功能,如可以调控小RNA,影响转录组调控,该文献是不可多得的有关环状RNA的论述。原文快速阅读:http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n5/abs/nbt.2890.html





参考文献
    Jeck WR,   Sharpless NE:   Detecting and characterizing circular RNAs. Nature biotechnology 2014, 32(5):453-461. 
 
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